大洋协会从“十五”启动了大洋基因资源的研究，于2001年成立了“中国大洋生物基因资源研发基地”。通过十年来的努力，建立了深海环境模拟与微生物培养平台，获取了三大洋深海各类生物样品，分离培养出了包括极端微生物在内的各类微生物5000多株，实现了海洋微生物资源的共享。在此基础上，开展了极端酶、小分子活性物质、污染物降解、生物催化等方面的应用基础研究，取得了一批有一定国际影响的研究成果。为加强大洋样品管理，中国大洋协会同时建立了中国大洋样品馆和中国大洋生物样品库，促进了大洋样品的共享。