2012年在深海（微）生物资源获取、应用潜力评价等方面取得了明显进展。一是深海微生物资源海上调查取得新突破。2012年7-8月，组织实施了大洋26航次生物航段的调查任务, 在南大西洋中脊采集到大量的生物样品；二是深海微生物资源拥有量持续上升。从大洋样品中新分离获得1300多株微生物；完成了18个微生物新种的基本分类鉴定工作；完成了170个深海样品的多样性分析；建立了环境样品流式细胞分选单细胞与基因组扩增技术。三是深海微生物资源应用潜力评估取得良好进展。初步建立深海微生物馏分样品库，完成了650株海洋微生物代谢产物指纹图谱的分析，建立了人类重大疾病相关基因的多个转基因果蝇和斑马鱼系，获得具抗菌、抗肿瘤与抗污损活性的菌株分别56、31和8株；分离并鉴定了120种特殊结构的深海天然产物,其中28种为新结构，部分具有良好的生物活性；从大洋样品中筛选获得产酶菌株400多株；克隆了15个污染物降解相关酶的基因，对36个蛋白酶进行了分离纯化，获得了20个蛋白酶N端序列；进行了甲醛脱氢酶发酵条件优化完成了深海异源表达系统宿主菌Shewanella piezotolerans WP3能量利用体系的研究；初步阐明了高温条件下深海噬菌体GVE2感染导致宿主Geobacillus sp. E263裂解的过程。该项目共发表23篇SCI论文。